Start line:  
End line:  

Snippet Preview

Snippet HTML Code

Stack Overflow Questions
  /*
   * Licensed to the Apache Software Foundation (ASF) under one or more
   * contributor license agreements.  See the NOTICE file distributed with
   * this work for additional information regarding copyright ownership.
   * The ASF licenses this file to You under the Apache License, Version 2.0
   * (the "License"); you may not use this file except in compliance with
   * the License.  You may obtain a copy of the License at
   *
   *     http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
  *
  * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
  * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
  * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
  * See the License for the specific language governing permissions and
  * limitations under the License.
  */
 
 package org.apache.mahout.math.random;
 
 import java.util.List;
 import java.util.Map;
 
Multinomial sampler that allows updates to element probabilities. The basic idea is that sampling is done by using a simple balanced tree. Probabilities are kept in the tree so that we can navigate to any leaf in log N time. Updates are simple because we can just propagate them upwards.

In order to facilitate access by value, we maintain an additional map from value to tree node.

 
 public final class Multinomial<T> implements Sampler<T>, Iterable<T> {
   // these lists use heap ordering.  Thus, the root is at location 1, first level children at 2 and 3, second level
   // at 4, 5 and 6, 7.
   private final DoubleArrayList weight = new DoubleArrayList();
   private final List<T> values = Lists.newArrayList();
   private final Map<T, Integeritems = Maps.newHashMap();
   private Random rand = RandomUtils.getRandom();
 
   public Multinomial() {
     .add(0);
     .add(null);
   }
 
   public Multinomial(Multiset<T> counts) {
     this();
     Preconditions.checkArgument(!counts.isEmpty(), "Need some data to build sampler");
      = RandomUtils.getRandom();
     for (T t : counts.elementSet()) {
       add(tcounts.count(t));
     }
   }
 
   public Multinomial(Iterable<WeightedThing<T>> things) {
     this();
     for (WeightedThing<T> thing : things) {
       add(thing.getValue(), thing.getWeight());
     }
   }
 
   public void add(T valuedouble w) {
     Preconditions.checkNotNull(value);
     Preconditions.checkArgument(!.containsKey(value));
 
     int n = this..size();
     if (n == 1) {
       .add(w);
       .add(value);
       .put(value, 1);
     } else {
       // parent comes down
       .add(.get(n / 2));
       .add(.get(n / 2));
       .put(.get(n / 2), n);
       n++;
 
       // new item goes in
       .put(valuen);
       this..add(w);
       .add(value);
 
       // parents get incremented all the way to the root
       while (n > 1) {
         n /= 2;
         this..set(nthis..get(n) + w);
       }
     }
   }
 
   public double getWeight(T value) {
    if (.containsKey(value)) {
      return .get(.get(value));
    } else {
      return 0;
    }
  }
  public double getProbability(T value) {
    if (.containsKey(value)) {
      return .get(.get(value)) / .get(1);
    } else {
      return 0;
    }
  }
  public double getWeight() {
    if (.size() > 1) {
      return .get(1);
    } else {
      return 0;
    }
  }
  public void delete(T value) {
    set(value, 0);
  }
  public void set(T valuedouble newP) {
    Preconditions.checkArgument(.containsKey(value));
    int n = .get(value);
    if (newP <= 0) {
      // this makes the iterator not see such an element even though we leave a phantom in the tree
      // Leaving the phantom behind simplifies tree maintenance and testing, but isn't really necessary.
      .remove(value);
    }
    double oldP = .get(n);
    while (n > 0) {
      .set(n.get(n) - oldP + newP);
      n /= 2;
    }
  }
  public T sample() {
    Preconditions.checkArgument(!.isEmpty());
    return sample(.nextDouble());
  }
  public T sample(double u) {
    u *= .get(1);
    int n = 1;
    while (2 * n < .size()) {
      // children are at 2n and 2n+1
      double left = .get(2 * n);
      if (u <= left) {
        n = 2 * n;
      } else {
        u -= left;
        n = 2 * n + 1;
      }
    }
    return .get(n);
  }

  
Exposed for testing only. Returns a list of the leaf weights. These are in an order such that probing just before and after the cumulative sum of these weights will touch every element of the tree twice and thus will make it possible to test every possible left/right decision in navigating the tree.
    List<Doubler = Lists.newArrayList();
    int i = Integer.highestOneBit(.size());
    while (i < .size()) {
      r.add(.get(i));
      i++;
    }
    i /= 2;
    while (i < Integer.highestOneBit(.size())) {
      r.add(.get(i));
      i++;
    }
    return r;
  }
  public Iterator<T> iterator() {
    return new AbstractIterator<T>() {
      Iterator<T> valuesIterator = Iterables.skip(, 1).iterator();
      @Override
      protected T computeNext() {
        while (.hasNext()) {
          T next = .next();
          if (.containsKey(next)) {
            return next;
          }
        }
        return endOfData();
      }
    };
  }
New to GrepCode? Check out our FAQ X